論文資料の整理方法 (ブレスト編)

うーん。卒論で読み散らかした資料が山積していて、何とかしないといけませんなぁ。
資料の分類・整理方法について皆さんのお知恵を拝借させて頂きたく思います。

■問題
  論文や本を読んだまま、分類やインデックス付けを施さないと、
  後に特定の箇所を参照したくても
  資料のタイトルや、資料の所在を短時間で見つけることができず
  不便な思いをすることがある。

■必要な知恵
  検索性に優れ、一か所(1台のPC内)に所蔵されている電子ファイルはまだマシだとしても、
  電子ジャーナル化されていない論文や、斜め読みした本など、
  皆さんはどうやって分類・整理していますか?

例:
  全ての資料に<日付+通し番号>か何かで固有番号をふって、
  固有番号、内容、資料の所在 などをエクセルで管理。
  昔は○○の方法を採っていたがここが不便だった
  実践的な分類学については『□□』に詳しい
  頭で全て覚えるのは無理。
  Namazu、Search X、search-s for Namazu が便利

などなど。コメント頂ければ幸いです m(_ _)m